三九集团的上级对赵新先授权一个人说了算，可以说是三九先天性的失误，后来逐步发展成为领导制度和决策机制，这是一种制度性的缺陷。
1999年，三九集团进入了全盛阶段，这年9月，赵新先宣布：用5年时间把三九集团建成世界上最大、最先进的植物药生产企业；用10年时间，成为亚洲最大、最强的综合性制药企业；用15年时间进入世界500强。
赵新先提出的这个目标是怎样产生的？有什么依据？有没有经过科学、严肃的论证呢？没有。只不过是表达自己的雄心壮志而已，他自己想这样，就公开讲出去了。而这一阶段是三九急速的大规模扩张的时期。
一般都认为，决策失误、盲目扩张、核心业务的削弱是导致三九集团由盛而衰的主要原因。但是，如果透过现象看本质，应该说三九集团衰落的根本原因是制度问题，是领导体制和决策机制的问题，是长期一个人说了算的企业的必然结局。
2000年以后，三九集团的问题逐渐暴露出来，企业开始走下坡路。但即使这样，也没有任何机制来及早发现并制约赵新先并纠正他。本来，企业经营中有了问题也是正常的，关键是能不能早些发现，早些刹车，早些挽救，以减少损失。但在三九集团，没有这样的机制，即使有人发现错了，也无能为力，只能任凭企业沿着已有的错误走向更大的错误。三九如此，很多由盛到衰的企业也莫不如此，教训极为深刻。