在统治阶级利用谶纬证明自己应天受命的同时，农民阶级也巧妙地利用谶纬，作为组织发动农民起义的工具，以其人之道，还治其人之身。西晋惠帝太安二年（303年），张昌就利用“刘氏复兴，李氏为辅”的谶言发动起义，以山都县吏丘沈冒充圣人，易姓名为刘尼，诈称汉后，奉为天子；张昌自己改名为李辰，为相国，服色悉依汉朝故事。据史书记载，后赵、东晋、后秦、北魏、刘宋、南齐时，都有利用谶言作为发动和组织起义的口号，以反抗封建统治，其次数多达数十起。封建统治阶级利用谶纬神学来愚弄人民群众，农民起义也造作谶言，利用神权来作为反抗封建压迫和剥削的工具。
流传于社会的谶纬符命，在政治生活中显示出来的重要影响，也引起了佛、道二教的注意，在弘传道法的过程中，援引谶纬符命。三国时来到江南的西域僧人康僧会便通晓谶纬，当吴主孙皓问他什么是善恶报应时，即以谶纬符瑞来说明佛教的善恶报应是真实可信的。后赵时，佛图澄劝谏石勒行王政、布仁德时用的也是谶纬符瑞。刘宋时，僧含劝颜峻谨慎处事的话中更是表明他深信谶纬而不疑。道教同谶纬的关系更为密切。产生于道教之前的谶纬中吸取了不少中国古代的神仙方术，而谶纬中的一些内容又被后来的道教所吸取。在原始道教的经典《太平经》中就曾讲到要“洞通天地之图谶文”[21]。葛洪力倡丹鼎道派，宣传通过服食丹药，可以羽化成仙，而其根据，则不少援自谶纬。南朝道教改革的集大成者陶弘景更是精通图谶，援引图谶劝萧衍建梁代齐，仿照纬书命名《真诰》七篇。道教还用扶乩的方式造作了不少谶语和道经，出于东晋时的《太上洞渊神咒经》中就有不少称为“道言”的谶语。魏晋以后，谶语流入道书，以致造作谶语已成为道教的一项宗教活动。