后来，鸿蒙时期末年，鸿蒙碎裂，混沌产生，混沌如卵，盘古生于混沌之中，孕育万余年，醒后手撑天脚踏地，身高每天增长，天渐高，地渐厚。达到一定高度后，他便用巨斧劈开粘连处，相传巨斧为天河金星所化。久而久之清上浊下天地分明。盘古因过度劳累而仙逝，身躯化为山河湖泊，三山五岳，双眼化日月，眉发化为满天星辰，四肢化为撑天的四根柱子。盘古神尊的最后一口精气被鸿钧老祖幻化成人，后有鸿钧一气化三清的说法，分别是太清：太上老君，玉清：元始天尊，上清：通天教主。不过，在后世的道教之中并不承认鸿均道祖的存在。所以，关于鸿均道祖究竟是真是假，是以讹传讹还是确有其人，后世中人都不得而知。
而在盘古神尊羽化之后，洪荒世界才彻底开启，于是，也就诞生了洪荒十二君主。但盘古神尊最后究竟是羽化而去，还是云游天外，世人均是众说纷纭。有人认为盘古神尊功参造化，他留在华夏人间的不过是一具躯壳而已，其真灵早已离开了这片宇宙，翱翔于天外之地。也有人说，当年盘古神尊为使青天不落，大地不沉，已经耗尽了所有真灵元力，化道而逝了。但不管真相如何，盘古神尊的功绩都不容磨灭，为人敬仰。